홈택스 연말정산 프로그램을 이용하는 영세 사업자는 별도 회계 프로그램 없이 연말정산 업무를 전산처리할 수 있다. 이용자는 소득공제신고서 작성, 연말정산 세액계산, 근로자 교부용 원천징수영수증 출력, 지급명세서 전산 파일 생성 및 전자제출 등 기능을 활용할 수 있다.
중도퇴직자가 있는 사업자는 퇴직근로자 연말정산 과정에서 이 프로그램을 활용할 수 있다. 휴·폐업자는 퇴직근로자 관련 2010년 귀속분 연말정산과 근로소득 지급명세서 전자제출 등 기능을 활용할 수 있다.
지급명세서를 전자제출하는 사업자는 세액공제 혜택도 누릴 수 있다.
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